Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC008417.1-201ENST00000510014 565 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 CASC20-201ENST00000415932 1484 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TNFAIP3-211ENST00000621150 1613 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MKRN1-211ENST00000480552 906 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 LINC01591-202ENST00000522279 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AL357093.1-201ENST00000556926 458 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
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