Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

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Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RLFQ13129 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RLFQ13129 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RLFQ13129 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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