Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FOXF1Q12946 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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FOXF1Q12946 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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