Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTN1Q12860 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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CNTN1Q12860 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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