Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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BPTFQ12830 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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BPTFQ12830 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BPTFQ12830 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BPTFQ12830 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BPTFQ12830 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BPTFQ12830 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BPTFQ12830 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BPTFQ12830 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BPTFQ12830 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BPTFQ12830 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
BPTFQ12830 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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