Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC173Q0VFZ6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms