Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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SYCNQ0VAF6 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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SYCNQ0VAF6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SYCNQ0VAF6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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