Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RIPPLY1Q0D2K3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms