Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCC8Q09428 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABCC8Q09428 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms