Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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FAM27E3Q08E93 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
FAM27E3Q08E93 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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