Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DDR1Q08345 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DDR1Q08345 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms