Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SOX4Q06945 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SOX4Q06945 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms