Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FMODQ06828 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms