Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CALD1Q05682 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CALD1Q05682 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms