Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUCB1Q02818 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms