Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GCNT1Q02742 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCNT1Q02742 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms