Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DEFA6Q01524 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
DEFA6Q01524 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms