Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2BQ00403 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2BQ00403 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms