Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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FAM3AP98173 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM3AP98173 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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