Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
IFI35P80217 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFI35P80217 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFI35P80217 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFI35P80217 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFI35P80217 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFI35P80217 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFI35P80217 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFI35P80217 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFI35P80217 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IFI35P80217 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IFI35P80217 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IFI35P80217 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms