Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HERVK_113P63121 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms