Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
MCCD1P59942 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MCCD1P59942 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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