Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GDF10P55107 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178 ms