Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CACNA2D1P54289 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms