Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
AP3M2P53677 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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AP3M2P53677 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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AP3M2P53677 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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AP3M2P53677 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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AP3M2P53677 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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