Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GBX2P52951 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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GBX2P52951 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GBX2P52951 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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