Protein–RNA interactions for Protein: P49281

SLC11A2, Natural resistance-associated macrophage protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A2P49281 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A2P49281 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms