Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NESP48681 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NESP48681 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NESP48681 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NESP48681 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NESP48681 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NESP48681 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NESP48681 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NESP48681 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NESP48681 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NESP48681 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NESP48681 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NESP48681 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NESP48681 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NESP48681 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NESP48681 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NESP48681 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NESP48681 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms