Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RANGAP1P46060 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms