Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TGFBR1P36897 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 680.7 ms