Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms