Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HOXD10P28358 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms