Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLD1P28340 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLD1P28340 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLD1P28340 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLD1P28340 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
POLD1P28340 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
POLD1P28340 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
POLD1P28340 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms