Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SSFA2P28290 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms