Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NFKBIAP25963 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms