Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDCP19113 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDCP19113 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDCP19113 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms