Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ITGB6P18564 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGB6P18564 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGB6P18564 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGB6P18564 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGB6P18564 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGB6P18564 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGB6P18564 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGB6P18564 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGB6P18564 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGB6P18564 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGB6P18564 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ITGB6P18564 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ITGB6P18564 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ITGB6P18564 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITGB6P18564 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms