Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC2P02655 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC2P02655 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC2P02655 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC2P02655 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC2P02655 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms