Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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PDE6DO43924 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6DO43924 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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