Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALUO43852 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALUO43852 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CALUO43852 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CALUO43852 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CALUO43852 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CALUO43852 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CALUO43852 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CALUO43852 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CALUO43852 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALUO43852 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms