Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA2O43364 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXA2O43364 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms