Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UBXN8O00124 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms