Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF879B4DU55 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF879B4DU55 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms