Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SOBPA7XYQ1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOBPA7XYQ1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms