Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
C9orf92A6NGG3 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
C9orf92A6NGG3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms