Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSZ3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WSZ3 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
A0A087WSZ3 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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