Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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