Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BRPF3Q9ULD4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms