Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF346Q9UL40 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms