Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKIRAS1Q9NYS0 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NKIRAS1Q9NYS0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms